Es el proceso que sirve para sentar las bases y las reglas que regirán el funcionamiento y el futuro de la empresa familiar. Teniendo encuenta las caracteristicas especiales de estas organizaciones, donde se mezclan los roles de propietario, trabajador y familiar, este documento acordado establece las reglas que regirán en un futuro aspectos como el régimen de transmisión o la sucesión generacional. Estas reglas tienen que estar lo más consensuadas posible y en su elaboración es conveniente que participe un asesor ajeno a la familia, pues es la mejor forma de garantizar un mínimo de neutralidad y una apuesta acertada por el beneficio colectivo que no atienda a intereses individuales.

Aunque no existen Protocolos generales, puesto que cada compañia tiene que elaborar el suyo propio, los aspectos que se pueden recoger son los siguientes: Familia (miembros de la familia firmantes del Protocolo, generaciones, ramas familiares...), historia de la empresa (breve historia de la empresa familiar, trayectoria generacional, hechos relevantes, situación actual...), valores ( tradición de la empresa, tradición en la familia, visión empresarial...), órganos de gobierno (Consejo de Familia, Junta General de Accionistas, Consejo de Administración, Dirección General...), incorporación a la empresa familiar (normas y condiciones de acceso, formación, Comité de Evaluación y nombramientos...), remuneración y propiedad (politica de dividendos, valoración de participaciones, transmisión de las participaciones, liquidez, normas de remuneración, acceso y distribución de la propiedad...), capitulaciones matrimoniales y política testamentaria (regímenes económicos matrimoniales, separación y divorcio, usufructos, patrimonio empresarial y no empresarial...), conducta empresarial y social (compromiso con la responsabilidad ante empleados, proveedores y clientes, directivos y ejecutivos no familiares, mantenimiento del nombre y marca comercial en relación al familiar, operaciones arriesgadas...), etc.